後席は50：50分割可倒式を採用。新型ワゴンRでは荷室開口幅を先代モデル比で100mm拡大したほか、バックドアバランサーを室外に設置。これにより、後席の圧迫感を減らすとともに荷物の出し入れのしやすさと収納性を向上させている
